Algunos juegos de la 32X pueden presentar problemas de emulación. Algunos de ellos se listan a continuación.
| Juego | Problemas conocidos |
|---|---|
| Brutal Unleashed - Above the Claw | Softlock después del primer combate. |
| FIFA Soccer '96. | Texto del menú principal con diapositivas. Knuckles' Chaotix. |
| Knuckles' Chaotix | gráficos defectuosos en la pantalla de selección de jugador. |
| NBA Jam Tournament Edition | Problemas de framerate. |
| NFL Quarterback Club | Faltan algunos gráficos del menú. |
| Virtua Racing Deluxe | línea intermitente al mostrar el logotipo de SEGA. |
| World Series Baseball Starring Deion Sanders | Planta al empezar un partido. |
| WWF Raw | Faltan algunos gráficos. |