FBNeo suporta los 2 formatos, pero otros emuladores de cd Neogeo sólo soportan las versiones cdz parcheadas. Quiza lo mejor sea quedarse con estas últimas.
Los ficheros del proyecto redump están en formato .CUE con varios ficheros .BIN llamados multibin. Este core no soporta los multibin y hay que convertir estos juegos para que tengan un único archivo bin.
Podéis hacerlo con el software CDmage 1.02.1:
File > Open > Seleccionad vuestro juego en formato .CUE
File > Save As > Introducid un nuevo nombre para vuestro juego para no sobreescribir el existente y pulsad `Save'.
OK.Fuentes: